Ο Ιωάννης Πλιάκος έχει εξειδικευτεί στη χειρουργική των ενδοκρινών αδένων, η οποία έχει ως αντικείμενο κυρίως τον θυρεοειδή αδένα, τους παραθυρεοειδείς, τα επινεφρίδια και το πάγκρεας. Η εξειδίκευσή του στους ενδοκρινείς αδένες άρχισε από το πρώτο έτος εξειδίκευσης στη Γ’ Χειρουργική Κλινική του Π.Γ.Ν.Θ ΑΧΕΠΑ. Η Γ’ Χειρουργική είναι η πρώτη κλινική στην Βόρεια Ελλάδα όπου άρχισε συστηματικά η χειρουργική αντιμετώπιση ασθενών με παθήσεις των ενδοκρινών αδένων. Ο Ιωάννης Πλιάκος συνέχισε την μετέπειτα χειρουργική του πορεία λαμβάνοντας μέρος σε πλειάδα μετεκπαιδευτικών σεμιναρίων και συνεδρίων πάνω στη χειρουργική ενδοκρινών αδένων. Είναι μέλος της Ελληνικής και της Ευρωπαϊκής Εταιρείας Χειρουργικής Ενδοκρινών Αδένων, είναι διδάσκων στο μεταπτυχιακό πρόγραμμα χειρουργικής ενδοκρινών αδένων του Α.Π.Θ και καλείται συχνά να μιλήσει σε συνέδρια που αφορούν την χειρουργική των ενδοκρινών αδένων.
Ο ιατρός χειρουργεί κάθε χρόνο εκατοντάδες ασθενείς με παθήσεις των ενδοκρινών αδένων. Στον θυρεοειδή διενεργεί την ελάχιστα επεμβατική θυρεοειδεκτομή με την μικρότερη δυνατή τομή μήκους περίπου δύο εκατοστών ή και χωρίς τομή με την επέμβαση να διενεργείται ενδοσκοπικά από το στόμα. Με γνώμονα πάντα την ασφάλεια του ασθενούς χρησιμοποιούνται τα πιο εξελιγμένα χειρουργικά βοηθήματα ώστε να εξαλειφθούν οι μετεγχειρητικές επιπλοκές: ο νευροδιεγέρτης που προστατεύει από βλάβη του νεύρου της φωνής και ο αυτοφθορισμός των παραθυρεοειδών που προστατεύει από βλάβη των παραθυρεοειδών αδένων κατά την διάρκεια της θυρεοειδεκτομής.
Ο ιατρός διενεργεί την ελάχιστα επεμβατική παραθυρεοειδεκτομή με τη χρήση της ταχείας μέτρησης της παραθορμόνης και της ταχείας βιοψίας. Στις απαιτητικές, στις «δύσκολες» παραθυρεοειδεκτομές, αλλά και στις επανεπεμβάσεις (αποτυχία εύρεσης του παθολογικού παραθυρεοειδούς στο πρώτο χειρουργείο) διενεργείται η σπινθηρογραφικά καθοδηγούμενη παραθυρεοειδεκτομή, τεχνική που εγγυάται την απόλυτη επιτυχία της έκβασης της επέμβασης.
Όταν πρέπει να αφαιρεθεί το επινεφρίδιο, ο ιατρός χρησιμοποιεί είτε την λαπαροσκοπική είτε την ενδοσκοπική μέθοδο, η οποία γίνεται με οπισθοπεριτοναϊκή προσπέλαση (με μικρή τομή από την πλάτη). Η ενδοσκοπική μέθοδος είναι η πιο σύγχρονη μέθοδος, διενεργείται από ελάχιστους χειρουργούς πανευρωπαϊκά και συγκρινόμενη με τις υπόλοιπες μεθόδους εγγυάται την πιο γρήγορη επάνοδο του ασθενούς στις φυσιολογικές του δραστηριότητες.
Το σύνολο των επεμβάσεων που αναφέρθηκαν έχουν ως χρόνο νοσηλείας μία και μόνο ημέρα.
